Robotique
Ciphergen / Bio-Rad
Modul-Bio propose la mise en place d’un système robotique pour la préparation des puces à protéines suivant le protocole Ciphergen.
Ce système robotique comprend l’automatisation de la préparation des échantillons avec les étapes de fractionnement,
la préparation des puces à protéines comprenant le dépôt des sérums ainsi que le dépôt de matrice.
- Gestion fiable et reproductible des faibles volumes réactionnels jusqu'à 1µL même avec des mélanges complexes de type matrice (ex. acétonitrile / acide sinapinique / acide trifluoro acétique).
- Processus entièrement automatisé, dépôt de matrice compris.
- Faibles coefficients de variation (10%) sur les intensités, résolutions et rapport signal-bruit des m/z de référence dans la gamme des protéines de masse comprises entre 2500 et 30 000 Da.
- Possibilité d'investigations fiables et reproductibles des m/z de
petite masse (< 6 000 Da.) - Possibilité de traitement des 96 spots d'un bioprocesseur de façon simultanée grâce à l'utilisation d'une tête 96 canaux.
- Flexibilité avec utilisation possible de plusieurs types surfaces de rétention chromatographique au sein d'un même bioprocesseur .
- Haut débit avec possibilité de gérer jusqu'à 4 bioprocesseurs par plateforme.
- Traçabilité par codes à barres.
- Randomisation du dépôt des échantillons facilitée par l'interfaçage avec le Virtual Note Book du logiciel pilotant le SELDI (Bio-Rad) .
-configuration de pipetage 8 tips (LIHA) et/ou 96 tips (MCA)
-avec ou sans lecteur de codes à barres (POSID)
-avec ou sans bras manipulateur (ROMA).
-automatisation de la préparation des échantillons de sérum
-automatisation du fractionnement des échantillons de sérum
-automatisation de la préparation jusque 4 bioprocesseurs Ciphergen avec dépôt des échantillons
-automatisation du dépôt de matrice.
-tous les programmes sont conçus de manière à donner à l’utilisateur un maximum de flexibilité.
Tous les programmes Modul-Bio pilotant les robots Tecan possèdent des « Classes liquides » (paramètres d’aspiration, de distribution variant en fonction du type de liquide, du volume pipeté, etc) permettant des volumes optimisés.
Une interface graphique Java MBioCipher permettant à l’utilisateur de sélectionner les types de barrettes pour 4 bioprocesseurs, le nombre d'échantillons et le volume de sérum à déposer.
-réarrangement des échantillons de tubes en DeepWell96 suivant le plan de plaque fourni par le logiciel Ciphergen
-copie plaques filles MTP96 et rack 2D à partir de la plaque DeepWell96
-enregistrement des paramètres du pipetage des bioprocesseurs (type et lot des réactifs et de la matrice)
Jusque 4 agitateurs magnétiques peuvent être intégrés aux programmes développés par Modul-Bio Ces agitateurs permettent diverses séquences d’agitation (Nord Sud, Est Ouest, Nord Est Sud Ouest, Nord Ouest Sud Est) à différentes fréquences entrecoupés ou non de pause de durée variable.
Publication: Automated, high throughput preparation of ProteinChip Arrays for SELDI-TOF MS profiling
Laurent Jacotot*Φ, Philippe Vaglio*, Anthony Gonçalves1, 2, 4, Yves Toiron1, Hagay Sobol3, 4, Jean-Paul Borg1, Xavier Saunier5, Emmanuel Russo5

